本发明提供了一种利用HRM 法进行牦牛与黄牛肉源性鉴别的方法，包括以下步骤:1)选取牦牛线粒体12SrRNA基因中和黄牛12S TRNA基因的差异位点，根据选取的差异位点，设计标记引物和标记探针;2)提取待测样品的全基因组 DNA:3)以步骤 2)中得到的待测样品全基因组 DNA 为模板，加入步骤1)中所述的标记引物和标记探针进行不对称PCR扩增得到PCR扩增产物;4)用HRM法检测步骤3)中得到的PCR扩增产物的熔解温度，绘制熔解曲线，若熔解峰在55~60℃温度范围内，则待测样品为牦牛肉，若熔解峰在 65~70℃范围内，则待测样品为黄牛肉。