本发明为一种基于胶原蛋白改性的阳离子絮凝剂及其制备方法，该阳离子絮凝剂由以下方法制备而成：步骤一，以胰蛋白酶为水解剂，对工业明胶进行水解，得到胶原蛋白溶液；步骤二，利用乙醛酸或没食子酸，对所得胶原蛋白溶液进行以增加胶原蛋白分子上羧基或酚羟基含量为目的的改性，得到改性胶原蛋白溶液；步骤三，将所得的改性胶原蛋白溶液与硫酸铁或者与硫酸铝，按照质量比1∶2～1∶4进行络合，即得到基于胶原蛋白改性的阳离子絮凝剂。本发明可用于废弃钻井液的处理，解决了目前废弃钻井液处理过程中，现用絮凝剂所存在的制备成本较高、合成或降解产物具有强烈毒性及致癌性，并会对环境造成严重污染的问题。